孔板流量計和其他的流量計一樣，故障都是通過它的輸出信號反應出來的，所以分析判斷故障原因大多都是從輸出信號的異常現象入手的。一體化孔板流量計有很多種檢測方式和檢測技術。所采用的檢測元件也是多種多樣的，與各種檢測元件配套的測量電路，也有較大的差別，所以說當儀器出現問題的時候，表現的形式也是各有不同的。但是這些不同都是僅限于孔板流量計的前面部分（就是檢測元件和前置放大電路部分）。后面的信號處理部分，如濾波電路，整形電路，a/D轉換和微處理器，顯示單元等都是相似的。所以常見故障也都具有共性。

通電后，無流量時有輸出信號。這種現象往往有以下幾種表現形式：
（1）處于間歇工作狀態的流量計，電源未端，閥門關閉，輸出信號不回零；這種現象可能的原因與第一種現象相同，主要原因可能是管道振蕩影響和外界電磁干擾。應該采取調低轉換器的靈敏度，提高整形電爐的觸發電平，可抑制噪聲，克服間隙期間的誤觸發。
（2）接通電源，閥門未開，有輸出信號；產生這種故障的原因可能就是外界的干擾，因此當出現這些問題的時候，我們應采取的措施是加強屏蔽和接地，消除管道振動，調整降低轉換器的靈敏度。
（3）通電狀態下，關閉下有閥門，輸出不回零，關上游閥門輸出回零；這主要來自流量計上游流體脈動壓力的影響。
（4）通電狀態下，關上游閥門輸出不回零，只有關下游閥門輸出回零；這種故障是管內流體擾動引起的，擾動來自孔板流量計下游管道。出現這樣的故障的時候我們的解決辦法就是下游直管段，減小六條擾動的影響。